SPR(표면 플라스몬 공명)은 유기 화합물, 단백질, 핵산 및 세포와 같이 다양한 생체분자간 상호 작용을 실시간으로 분석하고 연구에 활용하는 생명공학 기술입니다. 싸이티바의 Biacore™은 세계 최초의 SPR 기반의 바이오 센서로 약물 발견, 항체 특성, 단백질학 등 다양한 생명과학 연구에서 활용되고 있습니다.
SPR 관련 자주 묻는 질문과 그에 대한 답을 아래에서 확인해보세요.
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[NEW] Biacore에서 얻은 data를 개별 PC 에서 분석하고 싶습니다. 어떻게 해야 하나요?
Biacore에서 얻은 data를 개인 PC에서 분석 하고자 하실 경우 Biacore insight evaluation software를 구매하시면 분석이 가능합니다.
이 소프트웨어는 1 year or permanent 선택이 가능하며 합리적인 가격으로 제공이 됩니다. 기본적인 affinity, kinetics 분석은 물론 다양한 application 분석에도 사용이 가능합니다.
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[NEW] Evaluation 결과에서 Quality control 창에서 RI가 높다고 표기가 됩니다. 어떻게 해석을 해야 하나요?
RI는 Bulk 효과를 수치적으로 나타내는 것으로 running buffer와 sample solution의 굴절률 차이로 인한 것입니다.
만약 sample과 running buffer가 다른 경우 reference surface 을 사용하여 bulk contribution을 뺄 수 있습니다.
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[New] Reference cell 을 뺀 sensorgram 에서 마이너스로 관찰이 됩니다. 어떤 문제가 있을까요?
1. 기준 셀에 대한 비특이적 흡착량이 리간드 고정화 셀의 결합량보다 많다.
→ 레퍼런스 셀의 처리 방법이나 측정 조건의 변경이 필요합니다.
2. 아날라이트에 유기 용매나 글리세롤 등의 고밀도 성분을 포함
→ 완충액 치환을 실시하거나 용매 보정을 실시할 필요가 있습니다.
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Biacore Insight Machine learning이 무엇인가요?링크된 영상을 통해, Supervised machine learning for Biacore™ SPR analysis - a path for increased productivity 를 확인해보세요.
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Biacore 실험에 필요한 consumables선택 가이드가 있을까요?링크된 페이지를 통해 Biacore consumables selection tool 을 확인해보세요.
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Biacore를 이용하여 Epitope binning immunoassays를 측정할 수 있나요?링크된 페이지를 통해 Epitope binning immunoassays 측정에 대해 자세히 확인해보세요.
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Biacore 실험에서 어떠한 단백질을 고정화 하고 어떠한 단백질을 흘려줘야 하나요?Biacore 실험에서 chip 표면에 부착하는 물질을 ligand(리간드)라고 합니다.
리간드로 사용하면 좋은 조건은, Tagged protein, 단백질의 양이 적은 샘플, 순도가 높은 샘플, 분자량이 작은 단백질을 우선적으로 chip 표면에 부착을 하는 것이 좋습니다. -
SPR을 이용하여 막단백질의 친화력을 측정할 수 있습니까?네, 막단백질은 Detergent solubilization과 나노 디스크와 같은 다양한 방법 처리하여 측정이 가능합니다.
또한 detergent 없이 막 단백질 용해도를 유지하는 양친매성폴리머(amphipols)를 사용한다면, 바이오틴 태그를 활용하여 sensor chip SA로 캡쳐하여 실험이 가능합니다. -
기기 감도와 관련하여 BIACORE 8K는 BIACORE S200과 관련하여 어떤가요?Biacore 8K와 Biacore S200은 모두 매우 민감한 기기입니다. 분자량에 대한 하한선은 없으며 매우 넓은 동적 범위와 낮은 RU 수준에서 kinetics를 측정할 수 있습니다.
그러나 Biacore S200은 background noise가 약간 낮고 데이터 수집 속도가 40Hz입니다.
즉, Biacore S200에서 더 빠른 바인딩을 캡처할 수 있고 mRU 수준에서 더 나은 해상도를 얻을 수도 있습니다.
이러한 특징은 매우 낮은 리간드 고정화 레벨과 활성화가 적은 단백질인 경우에 유리합니다. 대부분의 응용 분야에서 두 기기는 감도와 관련하여 동일합니다. -
Biacore를 사용해서 fragment screening 을 수행 할 때 왜 높은 농도의 샘플을 사용하나요?fragment의 2차 상호 작용 및 기타 유형의 원치 않는 상호작용은 더 높은 농도에서 감지하기가 쉽습니다.
따라서 고농도에서 스크리닝 실험을 수행하면 프로세스 초기에 이러한 원치 않는 상호작용을 쉽게 식별 할 수 있으므로 후속 실험에서 시간을 절약할 수 있습니다.